Chùa Ngọa Vân tọa lạc tại núi Bảo Đài thuộc thôn Tây Sơn, xã Bình Khê, huyện Đông Triều, là di tích quan trọng bậc nhất trong Khu di tích Quốc gia đặc biệt nhà Trần tại Đông Triều - nơi hóa Phật của Đức Vua - Phật Hoàng Trần Nhân Tông - được coi là thánh địa của Phật giáo Trúc Lâm nói riêng và Phật giáo Việt Nam nói chung.
Trải qua thời gian và những biến thiên của lịch sử, quần thể Ngọa Vân đã dần mai một và hoang phế. Nhận rõ vị trí, tầm quan trọng và những giá trị to lớn của quần thể di tích Ngọa Vân trong lịch sử, từ năm 2007 đến năm 2009, huyện Đông Triều đã phối hợp với Viện Khảo cổ học tiến hành điều tra, nghiên cứu khảo cổ học di tích Ngọa Vân nhằm cung cấp các cơ sở khoa học cho việc quy hoạch, trùng tu, tôn tạo, quảng bá và phát huy giá trị di tích.
Năm 2013, Thủ tướng Chính Phủ đã phê duyệt Quy hoạch tổng thể bảo tồn và phát huy giá trị khu di tích lịch sử Nhà Trần ở Đông Triều.
Theo đó, dự án có tổng mức đầu tư 95 tỷ đồng và được trùng tu dựa trên nguyên tắc bảo đảm và phát huy giá trị chân thực của Di tích.
Đây là dự án khởi đầu cho các dự án tu bổ, tôn tạo, xây dựng các di tích thuộc khu di tích nhà Trần ở Đông Triều và có ý nghĩa to lớn trong việc hướng về cội nguồn dân tộc, tri ân các bậc tiền nhân và Điều ngự Giác hoàng Trần Nhân Tông. Đây cũng là điểm nhấn quan trọng cho du lịch tâm linh của huyện Đông Triều, góp phần thúc đẩy sự phát triển và quảng bá hình ảnh du lịch tâm linh của Khu di tích lịch sử Quốc gia đặc biệt nhà Trần tại Đông Triều.